SWV de Eem is een vereniging van 22 samenwerkende schoolbesturen. De algemene ledenvergadering (ALV) is statutair het hoogste bestuursorgaan van SWV de Eem.
De ALV wordt gevormd door alle deelnemende schoolbesturen en is onder meer belast met het vaststellen van het ondersteuningsplan en de (meerjaren)begroting van het Samenwerkingsverband. De ALV heeft een onafhankelijke voorzitter.
De leden hebben daarnaast zitting in het Partnerberaad. Het Partnerberaad is opgericht om leden ook inhoudelijk te laten meepraten over het beleid van SWV de Eem. Zij kunnen de directeur-bestuurder gevraagd en ongevraagd adviseren over verenigingsaangelegenheden.
De directeur-bestuurder is verantwoordelijk voor de dagelijkse leiding van het Samenwerkingsverband.
Het toezicht is geheel onafhankelijk vormgegeven in een Raad van Toezicht. Deze bestaat uit de volgende personen:
- Hans Telkamp, voorzitter, lid auditcommissie
- Marianne Lanting
- Eddy Verrips, voorzitter remuneratiecommissie
- Roy Viring, voorzitter auditcommissie
- Marleen Weijzen, lid remuneratiecommissie